WordPress en su versión multisite añade el slug /blog a los singles de posts (y custom post types), resultando permalinks del tipo www.whatever.com/blog/categoria/nombre-de-la-entrada
En el 99% de los casos no querremos ver ahí ese /blog. Gestionar la estructura de permalinks es fácil, pero es importante tener en cuenta el orden.
1. En el admin de cada sitio, Ajustes > Enlaces Permanentes debe estar marcado a «Predeterminado»
[sitio]/wp-admin/options-permalink.php
2. En el Administrador de la Red > Sitios > [el sitio que corresponda] > Ajustes > Estructura de Permalinks, la cadena que necesitemos, por ejemplo /%category%/%postname%/
/wp-admin/network/site-settings.php
Es importante tener en cuenta que si volvemos al paso 1 y grabamos (a veces da la sensación de que «solo con mirar» :) ), vuelve a aparecer el /blog. Hay que olvidarse de tocar Enlaces Permanentes en cada sitio, y si se hace, volver a «Predeterminado», y repetir el paso 2.